爬行动物不是“真实存在”的类群
根据支序系统学，爬行动物和鸟类源于同一祖先
脊椎动物的分类一度很简单：鱼类、两栖类、爬行动物、鸟类和哺乳类。鸟类有羽毛和翅膀，爬行动物有鳞片且冷血，我们可以很轻松地为生活中遇到的脊椎动物归类。
然而，当1960年代德国昆虫学家Willi Hennig 提出了支序系统学后，一切都不一样了。支序系统学的分类方法更加合理，将共有特征和亲缘关系作为分类依据，以揭示不同物种演化上的相关性，然而，经过支序系统学修订的脊椎动物分类，大大超出了我们的惯常认识。
支序系统学引人注目的成果之一是，哺乳动物都来自同一个祖先物种，所有现存的和绝灭的哺乳动物都是它的后代，我们称这个祖先物种和它的所有后代为一个单系群，鸟类也是一个单系群，这是支序系统学唯一承认的分类单位。
可是爬行动物却没那么幸运了。以前的“爬行纲”这一分类单位在支序系统学中并不能得到承认，因为蜥蜴、鳄鱼等所谓爬行动物的祖先同时也是鸟类和哺乳动物的祖先，因此这三个类群其实可以合并成一个大类群——羊膜动物，可是爬行动物却无法从中分离出来，因为它们并非来自唯一的祖先物种。
两栖动物的境况则稍好一些，但也仅限于现生种类，如青蛙、蟾蜍、蚓螈、蝾螈等。如果考虑到那些灭绝的种类，两栖动物相关的支序便扩大到所有四足脊椎动物，它们面临着跟爬行动物一样的问题。
如果你觉得这种分类法实在太疯狂，那么你说对了。在日常工作中，科学家们还是愿意参照传统的分类方法和那些显而易见的特征，毕竟“爬行动物”总比“非鸟类、非哺乳动物的羊膜动物”来得琅琅上口。可是，支序系统学却大大丰富了我们对生物演化历程的认识。
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